復旦二附中坐落于復旦大學邯鄲路校區，與復旦附中比鄰而居。復旦二附中的前身為復旦子弟學校中學部，1978年成立，1985年改為現名，但作為子弟學校的性質仍不變：仍接受復旦大學與楊浦區教育局雙重領導，學生仍以復旦子弟為主體。