上海市腦血管病防治研究所是隸屬于上海科學院的全額撥款事業單位，于1997年3月14日組建，是從事腦血管病防治的專業研究機構。主要成員經歷了國家“八五”、“十五”、“十一五”攻關、國家自然科學基金、上海市科委重大項目、上海市政府重大專項基金和多項上海市科技發展基金等中風預防重大項目的研究。目前正承擔國家“十二五”攻關課題研究，并在中風預防研究領域取得了一系列重大的科研成果，曾經獲得國家科技進步二、三等獎和上海市技術進步獎。
研究所現有員工26名，其中具有高級職稱7人，中級職稱12人。專業科室設有中風社區預防、新藥開發和生物工程研究室。多年來，研究所一直致力于腦血管病的高危預防策略研究，建立了以腦血流動力學檢測為主要手段的中風預警軟件，研制開發出中風防治藥物及其系列產品，總結出有效、可行的中風高危個體篩查與干預管理方案。尤其在中風預警領域具有明顯的優勢，所建立的篩查工具敏感度達到80％以上。在“中風高危人群篩查與干預管理”一級預防策略研究中取得了重要進展。項目主要成果連續三個五年計劃被納入國家攻關課題的驗證性研究，中風高危個體篩查與干預管理方案被遴選為國家攻關課題社區腦卒中預防與控制的適宜技術。項目研究工作受到國家科技部、衛生部和上海市科委的高度關注和大力支持。
現因承接國家“十二五”科技攻關支撐計劃擴展性研究項目“腦卒中高危個體篩查與干預管理”，進一步開展示范社區腦卒中高危人群早期識別和干預技術的研究工作，將在全國篩選確定的各級醫療機構多中心地開展該項目。同時作為全國腦血管病防治研究辦公室、中國健康促進基金會、中國老年保健醫學研究會等部門共同發起的“腦卒中早期預警與腦血管健康管理”項目的技術支持單位，將于2014年在全國大型三甲醫院合作建立20家腦血管健康管理中心；并計劃在今后五年內實施“十、百、千”計劃，在全國建立1000家以上腦血管健康管理中心。